Η νέα υπουργική απόφαση φαίνεται πως έχει τόσο θετικά όσο και αρνητικά στοιχεία. Το θετικό είναι εισάγεται ένα περισσότερο αξιοκρατικό κριτήριο στις μεταγραφές, αφού δεν θα μπορεί κανείς να μεταπηδά σε τμήμα με βάση πολύ μεγαλύτερη από το βαθμό του. Με αυτό τον τρόπο στηρίζονται τόσο τα Τμήματα της Περιφέρειας –και ιδίως τα νεοϊδρυθέντα-, που «αιμορραγούσαν» από φοιτητές λόγω των μεταγραφών, όσο και τα κεντρικά Πανεπιστήμια, που συνήθως μετά τις μεταγραφές ο αριθμός των φοιτητών τους αυξάνονταν υπερβολικά, με αποτέλεσμα να μην μπορούν να ανταπεξέλθουν στις εκπαιδευτικές ανάγκες και στις δαπάνες φοιτητικής μέριμνας των φοιτητών τους, αφού οι σχετικοί πόροι δίδονται με βάση των αριθμό των εισακτέων φοιτητών κάθε Τμήματος και όχι τον αριθμό που διαμορφώνονταν μετά τη διαδικασία των μεταγραφών.
Από την άλλη οι νέες αντιστοιχίες, δημιουργούν ατύπως Τμήματα δύο ταχυτήτων, καθώς γίνεται διαχωρισμός ανάμεσα στα Τμήματα των πρώην ΤΕΙ που με τις συγχωνεύσεις «Γαβρόγλου» ιδρύθηκαν μέσα στα Πανεπιστήμια ως νέα τμήματα , και των ήδη λειτουργούντων των Πανεπιστημίων. Ουσιαστικά στις μετεγγραφές τα Τμήματα των πρώην ΤΕΙ έγιναν ξανά ΤΕΙ… Τέλος σε πολλές περιπτώσεις δημιουργείται σύγχυση όταν Τμήματα με την ίδια ονομασία και το ίδιο επιστημονικό αντικείμενο δεν θεωρούνται αντίστοιχα.